JR貨物は2001年3月5日、磐越東線の郡山〜大越間(31.3km)と身延線の甲府〜東花輪間(12.1km)の第2種鉄道事業廃止を申請した。運輸審議会は3月15日に専決承認した。国土交通省が廃止を許可し、両線区は3月31日付で廃止となる予定。
磐越東線は1999年度までセメント輸送、身延線は1998年度まで石油輸送に使われていた。廃止についてJR貨物は荷主の了解を得ている。